A vigilância genômica é o processo contínuo de monitoramento dos microrganismos que podem causar doenças (patógenos) e análise de suas características genéticas através de técnicas como o sequenciamento.

Ela auxilia os serviços de saúde pública a:

- Monitorar a evolução de agentes causadores de doenças infecciosas;

- Alertar sobre a disseminação de patógenos;

- Adaptar intervenções e recomendações para o público;

- Desenvolver e adaptar medidas de controle para mitigar ou interromper a propagação de doenças.

Atualmente, o Centro Estadual de Vigilância em Saúde (CEVS) mantém uma estratégia de vigilância genômica que visa compreender a dinâmica de transmissão dos principais vírus pandêmicos e epidêmicos ou com impacto na saúde pública, como SARS-CoV-2 (coronavírus), Dengue, Zika, Chikungunya, lyssavirus (raiva) e poxvirus (monkeypox). Os dados gerados nas análises genômicas são avaliados em conjunto dos dados clínico-epidemiológicos e as informações são compartilhadas com as diferentes instâncias da gestão da saúde pública estadual, subsidiando assim as tomadas de decisões sobre as medidas de controle das doenças causadas por esses vírus.

LO CDCT e o Lacen/RS são os laboratórios responsáveis pelos testes moleculares e sequenciamento genômico no CEVS/SES-RS.